Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 BECN1P2-201ENST00000407947 812 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PDZK1-202ENST00000417171 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KIF9-AS1-201ENST00000429315 4898 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CTAGE15-201ENST00000420911 2587 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC011294.1-202ENST00000451905 1947 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ARHGEF9-234ENST00000637557 4775 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 HAUS6-201ENST00000380496 3756 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SLIT2-203ENST00000503837 4752 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 WDR36-206ENST00000612402 6592 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms