Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 IGLVI-70-201ENST00000523272 390 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC009119.1-202ENST00000567342 543 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 TRAV6-201ENST00000390428 404 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC023794.4-201ENST00000551732 754 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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