Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SNRPFP62306 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SNRPFP62306 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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