Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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POLR2AP24928 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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POLR2AP24928 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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POLR2AP24928 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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POLR2AP24928 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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POLR2AP24928 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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