Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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IRF4Q15306 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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IRF4Q15306 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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IRF4Q15306 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IRF4Q15306 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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