Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CLEC4E-206ENST00000545274 730 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PDCD6IPP2-205ENST00000565892 498 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 FGG-204ENST00000405164 1539 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 KIF3AP1-201ENST00000454055 611 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC02385-201ENST00000547554 428 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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