Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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HOXD10P28358 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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HOXD10P28358 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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HOXD10P28358 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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HOXD10P28358 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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