Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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TCOF1Q13428 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
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TCOF1Q13428 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TCOF1Q13428 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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TCOF1Q13428 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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TCOF1Q13428 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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