Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRMP28827 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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