Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC018647.2-201ENST00000605778 4200 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DRICH1-202ENST00000614553 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 EMP1-201ENST00000256951 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PTGS1-205ENST00000540753 5375 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL353795.3-201ENST00000624351 5702 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SLC6A15-201ENST00000266682 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TCF4-246ENST00000570287 3163 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NOTCH2NL-203ENST00000578207 5042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SEL1L-201ENST00000336735 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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