Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.3 ms