Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
TMPOP42166 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
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