Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PCBP1-AS1-244ENST00000594376 1197 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL021807.1-201ENST00000607175 565 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC074029.3-201ENST00000618623 312 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AP000851.2-201ENST00000629499 721 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC073488.5-201ENST00000631993 754 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MIR3120-201ENST00000636555 81 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FAM240B-202ENST00000637691 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR1J4-201ENST00000340750 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ATF3-204ENST00000366983 858 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 BEND6-201ENST00000370745 579 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PAGE5-203ENST00000374955 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MIR106B-201ENST00000385301 82 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TMEM199-202ENST00000395404 971 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC146944.2-202ENST00000425529 658 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 BX322234.2-202ENST00000435612 479 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC034238.2-201ENST00000445660 567 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC016683.1-201ENST00000446590 559 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RN7SL272P-201ENST00000487762 289 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms