Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 CRYZ-201ENST00000340866 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
RAB23Q9ULC3 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms