Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 RUNX1T1-252ENST00000617740 7627 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 GLRA2-201ENST00000218075 3216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 ZNF471-202ENST00000591537 5859 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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RNF17Q9BXT8 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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RNF17Q9BXT8 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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RNF17Q9BXT8 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC073065.1-201ENST00000411678 2866 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RNF17Q9BXT8 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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