Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
COG3Q96JB2 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms