Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 RNA5SP161-201ENST00000363871 115 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 LINC00578-201ENST00000439009 542 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC013643.2-201ENST00000521510 584 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC106875.2-201ENST00000617634 596 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 C12orf77-202ENST00000549262 1443 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 SERPINA9-202ENST00000337425 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AL138828.1-207ENST00000417643 734 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ATG4DQ86TL0 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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