Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 S100A4-201ENST00000354332 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC002367.1-201ENST00000416765 405 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 TRBV30-201ENST00000417977 447 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL355490.2-201ENST00000422848 548 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC02549-201ENST00000445346 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC02556-201ENST00000450776 346 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RN7SL519P-201ENST00000497925 288 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC100854.1-201ENST00000520351 341 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SPATA8-202ENST00000558553 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC010615.2-205ENST00000599993 929 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL024497.1-201ENST00000412954 631 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP55-201ENST00000423136 803 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 KIAA1328-209ENST00000592521 1190 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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