Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms