Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms