Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AP003121.1-201ENST00000609845 414 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN9-207ENST00000531979 1601 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GPM6A-221ENST00000515090 1500 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC096745.2-201ENST00000627783 1914 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF577-201ENST00000301399 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 BMS1P1-201ENST00000374336 1332 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 FO393401.2-201ENST00000422009 1307 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TAS2R5-201ENST00000247883 1151 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MAP1LC3C-201ENST00000357246 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 VN2R10P-201ENST00000411871 853 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A5P2-201ENST00000413713 897 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PUDPP1-201ENST00000421058 495 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 KRT223P-201ENST00000422957 519 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SEPHS1P1-201ENST00000426891 958 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GHRL-207ENST00000437422 443 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 NEURL1-AS1-201ENST00000447820 439 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC01548-201ENST00000451980 696 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL109809.3-201ENST00000456875 246 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RPS27P12-201ENST00000464146 258 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 NPSR1-208ENST00000465305 814 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL496P-201ENST00000470372 290 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC015909.1-201ENST00000509943 839 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SNRPCP8-201ENST00000514820 211 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MIR2052HG-204ENST00000523442 550 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SSR2-215ENST00000529008 849 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AP002991.1-201ENST00000539305 574 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ANP32BP1-201ENST00000564205 1297 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC022558.2-201ENST00000566841 754 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC006557.4-201ENST00000585516 830 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF611-214ENST00000600943 560 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC005303.1-201ENST00000607906 740 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL121928.1-201ENST00000608017 521 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC244517.10-201ENST00000624396 548 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TMEM45A-201ENST00000323523 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC097662.1-204ENST00000396588 2214 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms