Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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