Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CEP44Q9C0F1 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CEP44Q9C0F1 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CEP44Q9C0F1 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CEP44Q9C0F1 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CEP44Q9C0F1 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CEP44Q9C0F1 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
CEP44Q9C0F1 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
CEP44Q9C0F1 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
CEP44Q9C0F1 ALKBH8-202ENST00000389568 2491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC093580.1-201ENST00000420549 671 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 RNF11P2-201ENST00000427702 440 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 LINC01852-201ENST00000434223 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 LINC01094-206ENST00000514130 594 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AP000907.3-201ENST00000530733 322 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AL391903.2-201ENST00000614532 247 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC087072.2-201ENST00000621060 682 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms