Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC245047.5-201ENST00000437312 556 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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