Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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CDH18Q13634 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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CDH18Q13634 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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CDH18Q13634 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CDH18Q13634 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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