Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC073525.1-203ENST00000547040 2631 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CDY1B-202ENST00000382407 2227 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SAXO1-203ENST00000542071 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 EIF4BP2-201ENST00000416702 1794 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 HHLA2-205ENST00000467562 1457 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP37-201ENST00000364494 296 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MICU1-203ENST00000398763 1224 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP136-201ENST00000410927 300 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC00426-202ENST00000417079 1045 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P27-201ENST00000429983 1135 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC104695.1-201ENST00000439700 849 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC092431.2-201ENST00000441658 318 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 IFNWP5-201ENST00000445100 588 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC012501.1-201ENST00000454312 555 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 YAP1P2-201ENST00000455104 610 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL598P-201ENST00000494391 294 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC244505.1-201ENST00000502642 307 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC01948-201ENST00000506836 656 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP197-201ENST00000517077 297 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC022695.2-201ENST00000518042 768 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC006065.2-201ENST00000536978 211 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC055736.1-201ENST00000548135 629 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AP004247.4-201ENST00000608484 942 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.39-201ENST00000614194 271 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 OR5AU1-204ENST00000641822 1197 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GUCY2GP-201ENST00000479705 3222 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PLRG1-201ENST00000302078 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC02291-201ENST00000355909 1670 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ATP9B-208ENST00000586722 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PCDH18-205ENST00000511115 1331 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H4F-201ENST00000244537 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms