Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SETBP1-201ENST00000282030 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 MYEF2-202ENST00000324324 10360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 ZNF286A-221ENST00000593105 5222 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COL24A1Q17RW2 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 NLRP3-203ENST00000366496 3996 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
COL24A1Q17RW2 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms