Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
IRF4Q15306 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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