Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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CDH18Q13634 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CDH18Q13634 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CDH18Q13634 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CDH18Q13634 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CDH18Q13634 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CDH18Q13634 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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CDH18Q13634 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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