Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL606490.3-201ENST00000422410 270 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356387.1-201ENST00000426321 476 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL337P-201ENST00000462468 301 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF186996.8-201ENST00000463158 907 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC17A1-203ENST00000468082 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL107P-201ENST00000478127 283 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL472P-201ENST00000492799 293 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM107-209ENST00000533070 726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM269-202ENST00000536543 983 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ULK4P3-202ENST00000565158 593 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4695-201ENST00000577305 74 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010680.5-201ENST00000605021 463 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 uc_338.24-201ENST00000617802 182 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239600.2-201ENST00000619615 1165 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02086-204ENST00000628006 786 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEPDC1B-202ENST00000453022 1569 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSACC-202ENST00000368252 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL583835.2-203ENST00000407271 440 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL10-AS1-204ENST00000436598 513 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED30-204ENST00000522839 476 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074032.1-202ENST00000552815 467 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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