Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms