Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 295.2 ms