Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms