Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
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