Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
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TPCN1Q9ULQ1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPCN1Q9ULQ1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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TPCN1Q9ULQ1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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TPCN1Q9ULQ1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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TPCN1Q9ULQ1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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TPCN1Q9ULQ1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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