Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PACSIN3Q9UKS6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms