Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO3A1Q9UIG8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms