Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJB4Q9UDY4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJB4Q9UDY4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms