Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC6Q9UBN7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms