Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNFX1Q9P2E3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNFX1Q9P2E3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms