Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HCN3Q9P1Z3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms