Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRD1Q9P1U0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms