Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD3Q9P035 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD3Q9P035 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms