Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A12Q9NXJ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms