Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM248Q9NWD8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM248Q9NWD8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms