Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms