Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUOX1Q9NRD9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms