Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHST12Q9NRB3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHST12Q9NRB3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms