Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYLDQ9NQC7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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