Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX9Q9NQ69 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms